中药资源研究团队发布绞股蓝染色体级高质量基因组助力绞股蓝高皂苷资源的改良
近日，DNA Research在线发表了广西中医药大学中药资源团队题为Chromosome-level genome assembly of Gynostemma pentaphyllum provides insights into gypenoside biosynthesis的研究论文。
该研究采用PacBio三代测序（403X）和Hi-C 技术（52X）对绞股蓝进行了测序，首次组装绞股蓝染色体级高质量基因组。组装的参考基因组大小为582 Mb，杂合度为0.90%，scaffold N50为50.78 Mb，BUSCO指数为94.90%，注释获得25,285个蛋白质编码基因。利用上述高质量基因组信息推定了参与绞股蓝皂苷生物合成的结构基因及其在不同组织部位的表达模式。此外，我们还通过WGCNA构建了调控绞股蓝皂苷生物合成的调控网络并推测出调控绞股蓝皂苷生物合成的相关转录因子。该研究为绞股蓝的遗传改良以及活性成分的合成调控提供了重要的理论基础。
